Please enter 17-23nt guide RNA sequence.
GenCRISPR HDR敲入模板设计工具使用指南
简单4步,快速获得精准的HDR敲入模板和sgRNA序列!支持150nt – 20kb的基因敲入模板设计,提供ssDNA、dsDNA、GenCircle dsDNA(环状模板)选项!
- 输入页面: 提供目标物种、目标基因信息,可选择特定编辑位点或根据特定guide RNA设计敲入模板
- 设计页面: 通过鼠标移动编辑位点,输入敲入序列,选择蛋白标签、同源臂长度、设计结果数量等
- 结果页面: 查看设计的HDR模板和sgRNA序列、On Target score、Off Target score等参数,选择合适的设计,可添加CTS序列提升敲入效率
- 下单页面: 选择您需要的规格,加购物车并成功提交询单即可
任何问题,欢迎联系专业的技术支持,邮箱:oligo@genscript.com.cn,电话:400-025-8686分机5812或5815。
选择编辑位置:
- 绿色竖线标签表示编辑位点。
-
当鼠标放置在绿色标签或其两端,并变为十字形状时,按住鼠标左键可调整绿色标签左右两端的位置,选择合适的编辑位置。
浏览序列谱图:
-
将鼠标放在序列图上,点击并滚动鼠标滚轮,可以放大序列谱图,显示每个碱基和氨基酸。
-
按住鼠标左键可将序列谱图自由向左或向右移动。
默认同源臂长度信息
当删除序列的长度≤70bp
- 针对≤100bp的敲入序列,同源臂长度默认为70nt
- 针对>100bp的敲入序列,同源臂长度默认为300nt
- 建议如果敲入序列长度≤2kb,选择ssDNA,推荐同源臂长度设置为250nt;选择dsDNA,推荐同源臂长度设置为150-200bp。如果敲入序列长度>2kb,同源臂长度推荐设置为300-500bp
当删除序列的长度>70bp
- 当删除序列的长度为70-299nt,同源臂长度默认为300nt
- 当删除序列的长度为300-499nt,同源臂长度默认为500nt
- 当删除序列的长度为500-1500nt,同源臂长度默认为700nt
排名是根据不同sgRNA的“与敲入位点的距离”,这个参数越小,排名越高。 如果“与敲入位点的距离”相同,sgRNA的“目标得分”越高,排名越高。
请根据您最重要的参数选择设计。
更高的on target评分代表着更高的编辑效率,参考文献 Doench-score。
设计结果排名顺序根据on/off target评分等综合评估排序。
更高的off target评分代表着更高的脱靶效应,参考文献 Doench-score。
设计结果排名顺序根据on/off target评分等综合评估排序。