- 在4号外显子中通过插入缺失,敲除人类结肠癌细胞HCT116中的K-ras位点,如图1所示。
- 对Cas9和gRNA递送颗粒进行慢病毒包装,HCT116细胞进行病毒滴度优化。对每个单克隆进行Sanger测序,选择K-ras基因在第4号外显子上敲除的纯合子,如图2所示。
- 通过Western Blot方法验证所选克隆中K-ras基因表达缺失,如图3所示。
图1:K-ras敲除方法
图2:亲代细胞和K-ras-/-HCT116细胞sanger测序
图3:K-ras敲除蛋白表达验证
提供多种CRISPR基因编辑细胞系,依托优势的化学合成长单链sgRNA,可采用编辑效率高、毒性低的RNP递送体系,同时支持慢病毒、质粒多种递送体系,为您提供指定目的基因、编辑区域和细胞的基因编辑细胞系服务。
服务类型 | 服务详情 | 细胞系选项* | 交付内容** | 交付周期 |
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GenCRISPR™ EZ knock-out服务 |
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90+种常见适合转染的细胞株(包括A549,CHO-K1,HT-29,MDA-MB-231,4T1,A20,HCT116,MCF7,MDCK,U937,RPMI 8866等) |
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3-6周(细胞池) 9-15周(细胞株) |
GenCRISPR™定制化Knock-out服务 | 8-11周(细胞池) 16-24周(细胞株) |
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GenCRISPR™定制化Knock-in服务 |
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任何细胞株 |
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12-25周(细胞株) |
GenCRISPR™全长基因敲除服务 |
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任何细胞株 |
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13-23周(细胞株) 6-10周(细胞池) |
备注:
* 一般由客户提供细胞系,如果提供细胞系,则需额外收费。且不提供原代细胞、干细胞或IPS细胞的基因编辑服务。
** 根据要求在mRNA或蛋白水平验证全等位基因修饰细胞株。两周一次的项目更新。
可选服务
附加服务 | 详情 |
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逆转录PCR(RT-PCR) | 通过RT-PCR进行测序,验证敲除克隆在CDS上插入缺失标记的mRNA水平。 |
Western blot | 通过WB实验验证敲除基因克隆,需提供于靶蛋白特异性结合的有效抗体。 |
FACS分析 | 通过FACS实验验证敲除基因克隆,需提供于靶蛋白特异性结合的有效抗体。 |
启动子活性分析 | 宿主细胞中启动子(Cbh/CMV/EFS)的活性分析提升gRNA-Cas9的切割效率。 |
脱靶分析 | 通过对前5个潜在的脱靶位点进行测序来确定基因敲除克隆 |
附加单克隆 | 从同一个细胞库中挑选出另外一个单克隆发给客户。 |
图1:K-ras敲除方法
图2:亲代细胞和K-ras-/-HCT116细胞sanger测序
图3:K-ras敲除蛋白表达验证
图1:GS等位基因缺失引起移码突变
图2:在GS敲除细胞裂解液中,anti-GS抗体未检测到谷氨酰胺合成酶
图3:DG44(GS-/-)的L-谷氨酰胺依赖性
图1:
图2:PCR验证gRNA对
图3:缺失克隆筛选